Protein Family : PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 122449394

Method ID:  5262 Method Name:  Malpighiales
Sequence Alignment:  View MSA Member Count:  17

17 Genes

Primary Identifier Defline Organism Name Symbol Length Chromosome Location
29646.t000002 (1 of 22) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) R. communis v0.1 297   29646: 11744-12040
Manes.08G053100 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 255   Chromosome08: 5358539-5358793
Manes.08G059800 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 288   Chromosome08: 6711060-6711347
Manes.01G039900 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 261   Chromosome01: 6573607-6573867
Manes.01G057700 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 437   Chromosome01: 16934215-16934651
Manes.09G090400 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 374   Chromosome09: 19361861-19362234
Manes.10G072800 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 363   Chromosome10: 11952999-11953361
Manes.10G076800 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 357   Chromosome10: 13529558-13529914
Manes.12G078300 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 417   Chromosome12: 8485901-8486317
Manes.13G099800 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 1016   Chromosome13: 21618546-21619561
Manes.13G101400 (1 of 13) PF03732 - Retrotransposon gag protein (Retrotrans_gag) M. esculenta v6.1 369   Chromosome13: 21979040-21979408
Manes.17G037000 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 527   Chromosome17: 16669202-16669728
Manes.17G109000 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 255   Chromosome17: 24917169-24917423
Manes.18G122700 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 363   Chromosome18: 12296910-12297272
Manes.18G126000 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 369   Chromosome18: 14044610-14044978
Manes.S016900 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 297   Scaffold00589: 248582-248878
Manes.S028400 (1 of 62) PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) M. esculenta v6.1 3254   Scaffold00766: 158623-161876

17 Members

Protein Name Organism Name Cluster ID Cluster Name Same Organism Count Method ID Method Name
Manes.08G053100.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.08G059800.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.S028400.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.17G037000.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.17G109000.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
29646.m001054 R. communis v0.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 1 5262 Malpighiales
Manes.01G057700.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.18G122700.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.01G039900.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.09G090400.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.13G101400.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.18G126000.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.10G076800.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.13G099800.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.S016900.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.12G078300.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales
Manes.10G072800.1.p M. esculenta v6.1 122449394 PF14244 - gag-polypeptide of LTR copia-type (UBN2_3) 16 5262 Malpighiales