Protein : Seita.3G193600.1.p S. italica v2.2

UniProt Accession:  ? K3Z338 Secondary Identifier:  PAC:32712244
Organism Name:  Setaria italica Length:  1653  
Name:  Seita.3G193600.1.p
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Proteins

11 Protein Domains

DB identifier Type Name
IPR012340 Domain Nucleic acid-binding, OB-fold
IPR012337 Domain Ribonuclease H-like domain
IPR003029 Domain S1 domain
IPR027999 Domain Death-like domain of Spt6
IPR017072 Family Transcription elongation factor Spt6
IPR028231 Domain Transcription elongation factor Spt6, YqgF domain
IPR028088 Domain Helix-turn-helix DNA-binding domain of Spt6
IPR006641 Domain YqgF/RNase H-like domain
IPR000980 Domain SH2 domain
IPR010994 Domain RuvA domain 2-like
IPR028083 Domain Spt6 acidic, N-terminal domain
 

Other

1 CDSs

DB identifier Length Chromosome Location
Organism . Name
Seita.3G193600.1_CDS 4962   scaffold_3: 14691324-14699201 Setaria italica

36 Ontology Annotations

Ontology Term Db Gene/Protein Name
SSF50249 SSF Seita.3G193600.1.p
SSF47781 SSF Seita.3G193600.1.p
SSF55550 SSF Seita.3G193600.1.p
SSF53098 SSF Seita.3G193600.1.p
PS50126 PROFILE Seita.3G193600.1.p
PIRSF036947 PIRSF Seita.3G193600.1.p
SSF158832 SSF Seita.3G193600.1.p
SM00732 SMART Seita.3G193600.1.p
K3Z338 UniProt Seita.3G193600.1.p
GO:0032784 GO Seita.3G193600.1.p
GO:0006357 GO Seita.3G193600.1.p
IPR003029 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR000980 InterPro Seita.3G193600.1.p
GO:0003676 GO Seita.3G193600.1.p
G3DSA:3.30.505.10 GENE3D Seita.3G193600.1.p
GO:0006139 GO Seita.3G193600.1.p
GO:0003677 GO Seita.3G193600.1.p
IPR012340 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR017072 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR006641 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR012337 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR010994 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR028088 InterPro Seita.3G193600.1.p
K11292 KEGG Seita.3G193600.1.p
IPR028231 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR027999 InterPro Seita.3G193600.1.p
IPR028083 InterPro Seita.3G193600.1.p
PF14639 PFAM Seita.3G193600.1.p
PF14635 PFAM Seita.3G193600.1.p
PF14878 PFAM Seita.3G193600.1.p

0 Pathway Components

0 Pathways